El Programa de Apoyo a Estudiantes Indígenas en Instituciones de Educación Superior (paeiies) es una iniciativa de base étnica implementada en México a partir del año 2001 con financiamiento de la Fundación Ford. En este artículo se presenta un análisis del Programa a partir de un estudio con egresados indígenas de dos universidades, que estuvieron adscritos a éste, desde la perspectiva de las teorías de justicia distributiva y la sociología de la desigualdad. En primer lugar, se revisa el panorama de iniciativas de base étnica en México, posteriormente, se analiza el surgimiento y los alcances institucionales del paeiies. Por último, se presentan los impactos que el Programa tuvo en los egresados indígenas en tres ámbitos, sus trayectorias escolares, la relación con sus comunidades y su inserción al mercado laboral.