O ensino de ciências deve se pautar em uma atuação que valorize a compreensão dos fenômenos naturais. Entendemos que o uso da matemática, no ensino de ciências, também deve ser pautado mais na compreensão dos conceitos matemáticos e não somente no domínio de algoritmos que constituem os cálculos que descrevem os fenômenos naturais. Assim, neste trabalho, entendemos que a matemática é uma área de conhecimento afim da ciência e que por este motivo deve ser também, objeto de estudos e reflexões dos/as docentes que ensinam ciências. O objetivo deste trabalho é apresentar e analisar o Projeto Caixa de Jogos Matemáticos. Foi realizada uma pesquisa qualitativa, com delineamento de pesquisa participante. Participaram estudantes e professores/as da educação básica e da universidade. Os resultados permitiram a construção de uma teorização capaz de defender o Projeto Caixa de Jogos Matemáticos para mediar conceitos relevantes para aprender ciências.