This article presents the principles of complex thinking applied to agroecology and how these parameters can be useful to observe contexts and connections not always taken into account in the construction of scientific research related to agrochemicals. The article analyzes the argumentation, the framework and the sources of journalistic material related to the research of the Agência Nacional de Vigilância Sanitária (Anvisa) that evaluated the risks of pesticides for the final consumer. The analysis of the texts presents different possibilities regarding construction of the news and of the sources’ influence over the conduct of the framingapplied to the theme as well as in the interpretation of the data and reporting on scientific research.Keywords: agroecology; complex thinking; environmental sociology; environmental communication.PAIVA, Raquel Lucena. Pensamento complexo, agroecologia e agrotóxicos: análise da inter-relação entre ciência, movimentos sociais e mídia no processo de construção social das informações sobre toxidade e risco. Estudos Sociedade e Agricultura, v. 27, n. 3, p. 547-565, out. 2019.Submitted in June 2019.Accepted in September 2019.Este artigo apresenta os princípios do pensamento complexo aplicado à agroecologia e como estes parâmetros podem ser úteis para observar contextos e conexões nem sempre levados em consideração na construção de uma pesquisa científica relacionada aos agrotóxicos. O artigo analisa a argumentação, o enquadramento e as fontes de matérias jornalísticas referentes à pesquisa da Agência Nacional de Vigilância Sanitária (Anvisa) que avaliou riscos dos agrotóxicos para o consumidor final. A análise dos textos apresenta diferentes possibilidades de construção da notícia e a influência das fontes na condução do enquadramento dado ao tema e na interpretação dos dados e do relatório de uma pesquisa científica.Palavras-chave: agroecologia; pensamento complexo; sociologia ambiental; comunicação ambiental.PAIVA, Raquel Lucena. Pensamento complexo, agroecologia e agrotóxicos: análise da inter-relação entre ciência, movimentos sociais e mídia no processo de construção social das informações sobre toxidade e risco. Estudos Sociedade e Agricultura, v. 27, n. 3, p. 547-565, out. 2019.Recebido em junho de 2019.Aceito em setembro de 2019.