En este artículo se exponen las limitaciones de planeación para la implementación de ordenamientos ecológicos que requieren coordinación tanto horizontal como vertical de los distintos niveles de gobierno y otros actores que permitan conocer, adaptar y aplicar de mejor manera la normatividad legal en el ámbito de competencia de cada una de estas instancias. Se propone la posible utilización de la evaluación ambiental estratégica (EAE) como una herramienta para fomentar la coordinación transversal entre las distintas instancias competentes para formular, aplicar, evaluar y dar seguimiento a los ordenamientos ecológicos y territoriales. Asimismo, se plantea la necesidad de fomentar un esquema de coordinación transversal entre instancias gubernamentales que operen en el territorio costero y de coordinación vertical entre éstas con respecto a los distintos ordenamientos ecológicos (general del territorio, regional, local y marino). Para ejemplificar, en el artículo se tomó como caso el ordenamiento ecológico regional y la manifestación de impacto ambiental en su modalidad regional (MIAR), mediante los cuales fue sometido uno de los proyectos más ambiciosos del sexenio de Vicente Fox, conocido como "Escalera náutica del Mar de Cortés, México".