O artigo apresenta algumas contribuições aos debates sobre a presença histórica de populações indígenas em fronteiras de Estados nacionais na América do Sul e suas trajetórias. A partir de pesquisas do autor e de outros investigadores, toma-se como ponto de partida os processos vividos por determinados grupos localizados nas fronteiras do Brasil com o Paraguai e a Bolívia (Mato Grosso do Sul) e com a França/ Guyane (Amapá). Pensar historicamente as presenças indígenas nessas fronteiras obriga que pesquisadores revejam conceitos e ferramentas teórico-metodológicas de abordagem, além de uma busca incessante por diálogos interdisciplinares e/ ou transdisciplinares. Tais diálogos se fazem notadamente entre a História e as Ciências Sociais, sobretudo com a Antropologia, constituindo a chamada História dos Índios ou História Indígena. Considerando-se as fronteiras como espaços transnacionais e fluidos, é possível analisar criticamente migrações e outras formas de deslocamentos, além da construção de identidades assumidas e/ ou atribuídas, utilizadas de acordo com as circunstâncias e conforme os contextos em que vivem os atores sociais. As comparações entre os Estados de Mato Grosso do Sul e do Amapá permitem entrever diferenças e similitudes nas situações histórico-sociais de populações indígenas que vivem em fronteiras, sejam essas étnicas, nacionais, etc.