A partir de un análisis desde la historia del consentimiento informado y la relación médico-paciente, este artículo busca mostrar los conflictos que suscitan entre los bienes jurídicos protegidos por el consentimiento informado, esto es, la autonomía y la salud del paciente. De esa manera, los resultados de la muestra son producto de la creación de una línea jurisprudencial de la corte constitucional acerca de los casos en particular en los cuales se enfrentan dichos derechos pero solo uno de ellos puede prevalecer. La práctica del Consentimiento Informado abre día a día un nuevo campo de posibilidades a la relación del médico con el paciente. En ese mundo de infinitas posibilidades, el derecho ha construido una serie de reglas que armonizan estos institutos a la naturaleza del caso en particular.Based on an analysis from the history of informed consent and the doctor-patient relationship, this article seeks to show the conflicts that arise between the legal rights protected by informed consent, that is, the autonomy and the health of the patient. In this way, the results of the sample are the product of the creation of a jurisprudential line of the constitutional court about the particular cases in which these rights are faced but only one of them can prevail. The practice of Informed Consent opens up a new field of possibilities every day for the relationship between the doctor and the patient. In this world of infinite possibilities, the law has built a series of rules that harmonize these institutes to the nature of the particular case.