After an overview through the processes of implantation of missionary structures among Amazonian populations, this article directs attention to the process of establishment of the Catholic Church in the Purus basin (Amazonas, Brazil) and its consolidation at the beginning of the 20th century, in the middle of the rubber crisis. In this trajectory of interactions between missionary activities and indigenous populations, the figure of the Spanish religious Isidoro Irigoyen, who worked in the region for 30 years (1938-1968), stands out during the socalled “Second Rubber Boom” and the subsequent decline of the Amazonian rubber market. The access to his diaries and reports on desobrigas –catechizing expeditions of indigenous and riverine people in the inner rainforest communities–, together with the reading of ecclesial and journalistic records, lead us to some keys to understand the dynamics of Catholicism during the later rubber boom in the region of the Purus River.Tras un panorama a través de los procesos de instauración de estructuras misioneras entre las poblaciones amazónicas, este artículo dirige la atención al proceso de implantación de la Iglesia católica en la cuenca del Purús (Amazonas, Brasil) y a su consolidación a comienzos del siglo xx, en plena crisis cauchera. En esta trayectoria de interacciones entre actividades misioneras y poblaciones indígenas, destaca la figura del religioso español Isidoro Irigoyen, que actuó en la región a lo largo de 30 años (1938-1968), durante el denominado “Segundo Ciclo Cauchero” y en la posterior decadencia del mercado gomero en Amazonia. El acceso a sus diarios y relatos sobre desobrigas –expediciones de catequización de indígenas y ribereños en la floresta amazónica–, junto con la lectura de registros eclesiales y periodísticos, nos conduce a algunas claves decomprensión de las dinámicas del catolicismo cauchero en la región del río Purús.