A pedagogical view about the design of isoxazolyl-penicillins of the ampc betalactamase receptor 1fcm using the docking molecular technique

Heredia Parra, Laura Alejandra; Vigoya Ovalle, Edson Armando; Ramírez Valencia, Astrid; Peña Prieto, Luis Eduardo

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Colección de los Centros Asociados
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Colombia
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Red Iberoamericana de Pedagogía - REDIPE - Cosecha
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dc.creator	Heredia Parra, Laura Alejandra
dc.creator	Vigoya Ovalle, Edson Armando
dc.creator	Ramírez Valencia, Astrid
dc.creator	Peña Prieto, Luis Eduardo
dc.date	2021-09-14
dc.date.accessioned	2022-03-29T19:38:28Z
dc.date.available	2022-03-29T19:38:28Z
dc.identifier	https://revista.redipe.org/index.php/1/article/view/1432
dc.identifier	10.36260/rbr.v10i9.1432
dc.identifier.uri	http://biblioteca-repositorio.clacso.edu.ar/handle/CLACSO/157707
dc.description	The present work mainly exposes the result of the search for molecules, derived from the structural changes of the drug Cloxacillin in its phenyl radical, which is chlorinated, likewise, the selection of the pharmacophore group is evidenced, which allowed to specify the aforementioned objective. Secondly, the selected target was beta-lactamase, with 1FCM nomenclature, registered in the database, Protein Data Bank, in the same way, the amino acids involved in non-covalent interactions are found, in this order of ideas, they were raised, 22 molecules that presented an affinity energy lower than -8.0 Kcal/mol, this data stated above, will become the reference value, to postulate 6 molecules that have registered a lower affinity, generated by the Autodock Vina software. To conclude, the structural optimization of the leading drug is given as a result, together with its new interactions in the amino acids LYS64, ASN149, THR313 and SER61.	en-US
dc.description	El presente trabajo expone Expone principalmente el resultado de la búsqueda de moléculas, derivadas de los cambios estructurales del fármaco Cloxacilina en su radical fenilo, el cual se encuentra clorado. Así mismo, pone en evidencia la selección del grupo farmacóforo, el cual permitió concretar el objetivo anteriormente mencionado. En segundo lugar, el target seleccionado fue la betalactamasa, con nomenclatura 1FCM, registrada en la base de datos, Protein Data Bank. De igual manera se encuentran los aminoácidos involucrados en las interacciones no covalentes. En este orden de ideas, se plantearon 22 moléculas que presentaron una energía de afinidad menor a -8.0 Kcal/mol, dato que sirve de referencia para postular 6 moléculas que hayan registrado una afinidad menor, generada por el software autodock vina. Finalmente, como resultado se obtiene la optimización estructural del fármaco líder junto con sus nuevas interacciones en los aminoácidos LYS64, ASN149, THR313 y SER61.	es-ES
dc.format	application/pdf
dc.language	eng
dc.publisher	Red Iberoamericana de Pedagogía	es-ES
dc.relation	https://revista.redipe.org/index.php/1/article/view/1432/1350
dc.rights	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0	es-ES
dc.source	Boletín Redipe Journal; Vol. 10 No. 9 (2021): Concepts and practices of learning and training; 121-137	en-US
dc.source	Revista Boletín Redipe; Vol. 10 Núm. 9 (2021): Concepciones y prácticas de aprendizaje y formación; 121-137	es-ES
dc.source	2256-1536
dc.subject	Cloxacillin	en-US
dc.subject	Isoxazolyl penicillins	en-US
dc.subject	Betalactamase	en-US
dc.subject	Molecular docking	en-US
dc.subject	Cloxacilina	es-ES
dc.subject	Isoxazolil penicilinas	es-ES
dc.subject	Betalactamasa	es-ES
dc.subject	Docking molecular	es-ES
dc.title	A pedagogical view about the design of isoxazolyl-penicillins of the ampc betalactamase receptor 1fcm using the docking molecular technique	en-US
dc.title	Una mirada pedagógica sobre el diseño de isoxazolil-penicilinas del receptor 1fcm de la betalactamasa ampc empleando la técnica de acoplamiento molecular	es-ES
dc.type	info:eu-repo/semantics/article
dc.type	info:eu-repo/semantics/publishedVersion