El Niño is a warming of surface sea temperatures in the eastern Pacific Ocean. Such climatic and oceanographic perturbations have dramatic impacts upon the environment and human adaptation. Multidisciplinary evidence from large-scale excavations at the late Valdivia ceremonial center of La Emerenciana, document repeated site abandonments in coastal El Oro Province related to El Niño events. Initial abandonment is related to an intense or Mega-El Niño dated to ca. 2150 B.C., and associated with fossil beach ridge formation. Reoccupation is dated to 2200 until 1450 B.C. Final abandonment of the ceremonial center is dated to ca. 1450 B.C. and is associated with an earthquake and a short-lived reoccupation. Multidisciplinary evidence from excavation, regional settlement survey and statistical evidence from shellfish frequencies are presented to document if repeated and final site abandonment was related to El Niño or a tsunami induced by tectonic events associated with El Niño. Results indicate widespread environmental degradation and geomorphological changes to the surrounding coastline were related to El Niño, and that it was clearly a factor to cultural development and adaptation. These documents provide evidence of the chronology, the intensities and impacts of ancient El Niño events at La Emerenciana and pre-Columbian occupations in the Arenillas River valley, El Oro Province, Ecuador.El Niño es un calentamiento en la superficie marítima al este del Océano Pacífico. Tal perturbación climática y oceanográfica tiene impactos dramáticos en el medio ambiente y en la adaptación humana. Evidencia multidisciplinaria recopilada en excavaciones realizadas en el centro ceremonial de La Emereciana, ocupación tardía de la cultura Valdivia en la provincia costera de El Oro, documentan repetidos abandonos en asentamientos relacionados a eventos de El Niño. Los abandonos iniciales se relacionan con un intenso o mega evento de El Niño alrededor del 2150 A.C., asociado con la formación fósil en la cresta de la playa. La reocupación está fechada entre los años 2200 A.C. y 1450 A.C. El abandono final del centro ceremonial está fechado alrededor del 1450 A.C., asociado a un terremoto y una breve reocupación. Evidencia multidisciplinar de excavaciones, mediciones de asentamientos regionales y evidencia estadística sobre las frecuencias de los crustáceos son presentadas para documentar si los abandonos recurrentes y definitivo del sitio estuvieron relacionados con El Niño o a Tsunamis inducidos por los eventos tectónicos vinculados con El Niño. Los resultados indican una amplia degradación ambiental y cambios geomorfológicos en el litoral marítimo circundante relacionados con El Niño, y que este fue claramente un factor para el desarrollo y la adaptación cultural. Estos documentos proveen evidencia de la cronología, la intensidad y los impactos de los antiguos eventos de El Niño en la Emereciana y en las ocupaciones pre-colombinas en el Valle del Río Arenillas, en la Provincia de El Oro, Ecuador.