In this article we present a reflection on research conducted to define a strategic gender equality indicators system. The system was dedicated to monitoring, in a synthetic and comprehensive way, the evolution of this phenomena in the Basque Country. Firstly, on the basis of the relevant literature on the subject, we examine the problems behind the measuring of gender inequality. Secondly, the indicators system is described: its aims, its relation with the existing equality information and evaluation tools and the main features of its elaboration. Finally, we discuss in greater detail what challenges appeared and the theoretical, conceptual and methodological decisions made. We give special attention to showing how we intended to grasp, with indicators, a feminist, broad, political, transformative and context-oriented concept of gender (in)equality.En este artículo reflexionamos sobre una investigación dirigida a definir un sistema estratégico de indicadores de igualdad de género para la Comunidad Autónoma de Euskadi que diera cuenta de la evolución de este fenómeno de forma sintética y comprensible. En primer lugar, planteamos la problemática de la medición de la desigualdad de género, recurriendo a la principal literatura sobre esta cuestión. En segundo lugar describimos de forma breve el sistema de indicadores construido: sus propósitos, su encaje en los sistemas de información y evaluación de la igualdad en este territorio en concreto, y las características de su proceso de elaboración. Posteriormente, pasamos a discutir con mayor detalle los dilemas aparecidos y las elecciones teóricas, conceptuales y metodológicas que realizamos, centrándonos en particular en cómo se ha afrontado el reto de capturar con indicadores un concepto de igualdad que sea amplio, político, transformador, adaptado al contexto vasco y acorde con los consensos feministas.