In Colombia, many initiatives have been proposed for the eradication of crops for illicit use without bringing with it a definitive solution. The execution of the Comprehensive National Program for the Substitution of illicit crops since its implementation in 2019 in the municipalities of La Montañita and Puerto Rico in Caquetá is examined through descriptively analyzed surveys and semi-structured interviews coded with the free software QDA Miner lite®. In these, it was sought to understand the complexities of its implementation from the particularities of the agricultural technical equipment, the conditions of the Immediate Attention Plan, the agricultural development and productive chain giving elements to reflect on implementation approaches and the transformative potential of the agricultural accompaniment protected by the National Agricultural Innovation System.En Colombia se han propuesto numerosas iniciativas para la erradicación de los cultivos de uso ilícito sin traer consigo una solución definitiva. Se examina la ejecución del Programa Nacional Integral de Sustitución de cultivos de uso ilícito desde su implementación en 2019 en los municipios de La Montañita y Puerto Rico en Caquetá a través de encuestas analizadas descriptivamente y entrevistas semiestructuradas codificadas con el software libre QDA Miner lite®. En estas, se buscó entender las complejidades de su implementación desde las particularidades de los equipos técnicos agropecuarios, las condiciones del Plan de Atención Inmediata, el desarrollo agropecuario y encadenamiento productivo dando elementos para reflexionar sobre enfoques de implementación y el potencial transformador del acompañamiento agropecuario a la luz del Sistema Nacional de Innovación Agropecuaria.